R语言 MASS库绘制平行图
为了分析和可视化高维数据,人们可以使用平行坐标。绘制一个由n条平行线组成的背景,通常是垂直和均匀间隔的,以显示n维空间中的一组点。n维空间中的一个点由平行轴上的顶点的折线表示;该点的第 i个坐标对应于第i个轴上 顶点的位置。
R编程语言中的MASS库的平行图
这种表示方法类似于时间序列的可视化,只是它用于没有自然顺序的数据,因为轴与时间点没有关联。因此,几个轴的布局可能会引起人们的兴趣。
使用MASS库的平行坐标
MASS软件包中的parcoord()函数可以自动创建一个平行坐标图。一个只有数字变量的数据框可以作为输入数据集。每个变量都将被用来构建图表的一个纵轴。
# Libraries
library(MASS)
# default data in R
data <- iris
head(data)
# plotting the graphs
parcoord(iris[, c(1:4)] , # choosing first 4 parameters
# selecting the color palette based on the plot
col = colors()[as.numeric(iris$Species)*8]
)
输出
Sepal.Length Sepal.Width Petal.Length Petal.Width Species
1 5.1 3.5 1.4 0.2 setosa
2 4.9 3.0 1.4 0.2 setosa
3 4.7 3.2 1.3 0.2 setosa
4 4.6 3.1 1.5 0.2 setosa
5 5.0 3.6 1.4 0.2 setosa
6 5.4 3.9 1.7 0.4 setosa
自定义调色板
基本上,这个包中没有任何内置的方法或属性用于颜色定制。我们将使用colorRampPalette()方法在两个指定的颜色点之间调色
# Libraries
library(MASS)
# choosing the graph color
library(RColorBrewer)
# default data in R
data <- iris
head(data)
# define a color palette
palette <- brewer.pal(5, "Set1")
# plotting the graphs
parcoord(iris[, c(1:4)] , # choosing first 4 parameters
# selecting the color palette based on the plot
col = palette[as.numeric(iris$Species)]
)
输出
Sepal.Length Sepal.Width Petal.Length Petal.Width Species
1 5.1 3.5 1.4 0.2 setosa
2 4.9 3.0 1.4 0.2 setosa
3 4.7 3.2 1.3 0.2 setosa
4 4.6 3.1 1.5 0.2 setosa
5 5.0 3.6 1.4 0.2 setosa
6 5.4 3.9 1.7 0.4 setosa