用R和ggraph绘制树形图的介绍

在这篇文章中，我们将看到如何用R编程的ggraph库将树状图可视化。ggraph库有一堆方法来帮助R编程语言的可视化。

树状图的可视化

树状图是项目之间层次关系的可视化表示。它最常作为分层聚类的结果产生。树状图的主要目的是为了找出将对象分配到聚类的最佳方法。

准备分层数据

在这里，我们要为演示准备分层数据。为此，我们将创建两个数据框架，然后我们将创建边缘数据。

# libraries for plotting the graph
library(ggraph) 
library(igraph)
library(tidyverse)
library(ggplot2)
  
# create the edge data for the hierarchy
d1 <- data.frame(from = "origin", 
                 to = paste("group",
                            seq(1,5),
                            sep = ""))
print("Dataframe 1 :")
head(d1)
  
# preparing the subgroup data
d2 <- data.frame(from = rep(d1$to, each = 5), 
                 to = paste("subgroup", 
                            seq(1,25),
                            sep="_"))
  
print("Dataframe 2 :")
head(d2)
  
# creating the edge data
edges <- rbind(d1, d2)
  
print("Edge of both dataframe:")
head(edges)

输出

准备好图表数据

graph_from_data_frame()方法从一个或两个数据帧中创建igraph图，其描述已从igraph包中获得。

语法： graph_from_data_frame(d, directed = TRUE)

参数

• d： 数据帧
• directed: 逻辑标量

# prepare the graph data
mygraph <- graph_from_data_frame( edges )
mygraph

输出

准备树状图

现在，我们将使用ggraph库绘制树状图。为此，我们将使用 ggraph 的 layout = ‘dendrogram ‘ 的树状图 布局 ， geom_edge_diagonal() 用于绘制边缘， geom_node_point() 用于数据点。

语法： ggraph(graph, layout)

参数

• graph: 图形对象
• layout: 布局类型实例，一个函数，一个矩阵，或一个数据框架

# plotting the dendrogram
ggraph(mygraph, layout = 'dendrogram') + 
  geom_edge_diagonal() + # putting up the edges
  geom_node_point() # add up the data points

输出