Pandas的to_csv()方法在保存大型数据框时速度较慢

Pandas的to_csv()方法在保存大型数据框时速度较慢

在本文中,我们将介绍当使用Pandas的to_csv()方法保存大型数据框时,遇到的速度较慢的问题,并提供可能的解决方法。

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数据框和to_csv方法

Pandas是一个用于数据分析的Python库,可用于创建和处理数据框。数据框是一个二维表格,具有行和列,类似于电子表格。Pandas具有一个名为to_csv()的方法,可将数据框保存为CSV(逗号分隔值)文件,可在多种应用程序中使用。

使用to_csv()方法保存数据框时,通常会将数据框输出到文件中,如下所示:

import pandas as pd
df = pd.DataFrame({'col1': [1, 2], 'col2': [3, 4]})
df.to_csv('data.csv')
Python

上述代码将数据框df保存到名为data.csv的文件中。这很方便,因为您可以随时加载数据框。但是当数据框很大时,Pandas的to_csv()方法可能会非常缓慢。

to_csv()方法速度慢的可能原因

当to_csv()方法保存大型数据框时,其速度变慢的主要原因可能是磁盘空间不足以保存在RAM中的所有数据,从而需要使用虚拟内存。将数据写入磁盘比将数据存储在RAM中慢得多,因此to_csv()方法的速度会减慢。

但是还有其他可能的原因:

  1. 写入文件是单线程进行的。这可能会导致I/O瓶颈,尤其是当使用机械硬盘时。

  2. 使用默认参数保存CSV文件。默认情况下,to_csv()方法使用逗号分隔值(comma-separated values)并将数据框的索引写入CSV文件。这些选项可能会增加文件大小和保存时间。

  3. 如果数据框包含NaN(或缺失值),则to_csv()方法可能会将它们保存为字符串“NaN”,这会导致文件更大。

如何提高to_csv()方法的速度?

有几种方法可以提高to_csv()方法的速度。下面是其中一些可能的解决方案:

  1. 使用文件模式:打开文件,然后使用循环逐行将数据添加到CSV文件中。这比将整个数据框写入CSV文件快得多。
with open('data.csv', 'w') as f:
    for index, row in df.iterrows():
        f.write(f'{row["col1"]},{row["col2"]}\n')
Python
  1. 更改参数:to_csv()方法有许多有用的参数,可以更改以提高速度。例如,使用参数sep =’\t’来将数据框保存为制表符分隔值文件,这通常比使用逗号分隔值快。您还可以将参数index = False传递给to_csv()方法,以便在保存数据框时不包含索引。
df.to_csv('data.tsv', sep='\t', index=False)
Python
  1. 处理NaN值:如果数据框包含NaN值,则可以使用参数na_rep = ”来将NaN值转换为空字符串。
df.to_csv('data.csv', na_rep='')
Python
  1. 并行处理:如果计算机具有多个CPU,则可以使用并行技术将数据框拆分为多个部分,然后同时写入多个CSV文件。
import multiprocessing as mp
def write_csv(args):
    filename, data = args
    data.to_csv(filename, index=False)

pool = mp.Pool(processes=4)
dataframes = np.array_split(df, 4)
filenames = [f'data{i}.csv' for i in range(4)]
results = pool.map(write_csv, zip(filenames,dataframes))
Python

这个代码示例将数据框分成四个部分,然后使用四个进程并行将它们写入四个CSV文件中。

总结

Pandas的to_csv()方法是一个强大而灵活的工具,用于将数据框保存到CSV文件中。但是当数据框很大时,它可能会变得非常缓慢。我们提出了几种解决方案,例如改变参数、使用文件模式、处理NaN值和并行处理。使用这些技术,您可以大大提高to_csv()方法在保存大型数据框时的速度。

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