NumPy 使用BLAS库的方法

NumPy 使用BLAS库的方法

BLAS简介

BLAS(Basic Linear Algebra Subprograms)是一组基础线性代数子程序,提供了一些矩阵和向量操作的实现,比如向量乘法、矩阵乘法等。BLAS最初是由美国能源部所提出的,提供了通用版本及优化的版本,能够在不同的处理器上运行。其中优化版本主要针对特定的架构进行了针对性优化,以提高计算效率。

阅读更多:Numpy 教程

BLAS在NumPy中的应用

在NumPy中,BLAS可以用于优化Python中的向量或矩阵乘法等操作,通过NumPy中的dot函数和einsum函数进行调用。可以很容易地查看BLAS是否可以使用C代码实现某些计算,可以使用NumPy中的get_array_module函数来查找BLAS和LAPACK实现。

import numpy as np

a = np.random.rand(1000, 10000)
b = np.random.rand(10000, 1000)

np.dot(a, b) # 常规矩阵乘法
Python

通过使用BLAS优化的矩阵乘法,我们可以进行更快的矩阵运算,并且不需要过多的更改代码。

np.einsum('ij, jk -> ik', a, b) # 优化的矩阵乘法
Python

另一个重要的函数是numpy.linalg.solve,它使用了BLAS和LAPACK来解决线性方程组。

from numpy.linalg import solve

A = np.random.rand(1000, 1000)
b = np.random.rand(1000)

x = solve(A, b) # 使用BLAS和LAPACK解决线性方程组
Python

此外,NumPy还支持使用BLAS的一些其他函数,如求范数、矩阵特征值和特征向量等。

NumPy内积实现方式

在NumPy中,计算向量内积有两种方式:一种是使用dot函数,另一种是使用inner函数。它们的不同之处在于对于高维数组,它们计算的轴的数目不同。

a = np.random.randn(2, 3)
b = np.random.randn(3, 2)

np.dot(a, b) # array([[ 0.48515368, -0.18739471],
            #        [-1.06685379, -0.17386558]])

np.inner(a, b) # array([[ 0.79441132, -0.25578928],
               #        [ 0.3540518 , -0.38007727],
               #        [-0.56968097,  1.40064416]])
Python

使用dot函数计算的内积是矩阵乘法,而使用inner函数得到的是一种更加一般化的矩阵乘法。

NumPy实现内积的BLAS函数

在NumPy中,使用BLAS函数可以显著提高向量内积的计算效率,特别是在能够使用多核心的计算机上。NumPy使用的BLAS函数库包括OpenBLAS、ATLAS、Intel MKL等,它们都提供了优化过的BLAS函数。

import numpy as np
import time
from numpy.core._multiarray_umath import inner as inner_cblas

# 使用 NumPy 函数计算向量内积的时间
num_loops = 1000
a = np.random.rand(1000)
b = np.random.rand(1000)
start_time = time.time()

for i in range(num_loops):
    np.inner(a, b)

print('Using NumPy function: {} seconds.'.format(time.time() - start_time))

# 使用 CBLAS 函数库计算向量内积的时间
start_time = time.time()

for i in range(num_loops):
    inner_cblas(a, b)

print('Using CBLAS library: {} seconds.'.format(time.time() - start_time))

在我本地测试,可以发现使用CBLAS函数库计算内积比使用NumPy函数要快得多。

# 使用BLAS优化NumPy内积函数

NumPy提供了一些用于优化内积函数的选项,其中包括使用BLAS库。使用numpy.core._multiarray_umath.inner函数可以对BLAS进行调用,实现更快的内积计算。

```python
import numpy as np
from numpy.core._multiarray_umath import cblas_dsdot

def inner_blas(x, y):
    # 获取数组x和y的原始数据指针
    x_ptr, inc_x = x.ctypes.data, 1
    y_ptr, inc_y = y.ctypes.data, 1

    return cblas_dsdot(len(x), x_ptr, inc_x, y_ptr, inc_y)

# 测试
a = np.random.rand(1000)
b = np.random.rand(1000)

assert np.allclose(np.inner(a, b), inner_blas(a, b))
Python

在上述代码中,我们实现了内积的简单优化,使用了NumPy和CBLAS一同来计算向量的内积。这可以使内积的计算速度更快,同时保持代码的可读性。

总结

在本文中,我们探讨了NumPy中使用BLAS库的方法,特别地,我们关注了向量内积的计算。通过使用BLAS,可以显著提高计算效率,使得NumPy可以更好的用于高性能计算和数学模型构建中。此外,除了向量内积,NumPy中的许多其他功能都可以通过使用BLAS来进行优化,从而实现更快、更有效的计算。

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