Numpy库导入时出现的错误:lapack_lite.so: undefined symbol
在本文中,我们将介绍在使用Numpy库时,可能会遇到的一种错误:lapack_lite.so: undefined symbol。该错误通常是由于Numpy库的依赖库OpenBLAS版本不兼容所导致的。具体表现为在Python的交互式环境或者运行脚本时,导入Numpy库时出现以下错误提示:
ImportError: /path/to/numpy/linalg/lapack_lite.so: undefined symbol: zgelsd_
或者
ImportError: /path/to/numpy/linalg/lapack_lite.so: undefined symbol: dgetf2_
其中,zgelsd_和dgetf2_是OpenBLAS库中定义的函数。
阅读更多:Numpy 教程
解决方法
我们可以通过以下三种方法,解决Numpy导入时出现的undefined symbol错误。
方法一:更新OpenBLAS库
错误的根本原因是Numpy库需要的依赖库OpenBLAS版本不兼容。因此,我们可以尝试更新OpenBLAS库。
一种简单的方法是使用系统自带的软件包管理器进行更新。以Ubuntu系统为例,可以使用以下命令进行更新:
$ sudo apt-get update
$ sudo apt-get install libopenblas-dev
如果系统自带的OpenBLAS库已经是最新的,也可以尝试从OpenBLAS官网上下载最新版本的库进行编译安装。以Linux系统为例,可以使用以下命令进行编译安装:
$ wget https://github.com/xianyi/OpenBLAS/archive/v0.3.13.tar.gz
$ tar -zxvf v0.3.13.tar.gz && cd OpenBLAS-0.3.13
$ make -j$(nproc) && sudo make install
方法二:重新编译Numpy库
如果更新OpenBLAS库仍然无法解决问题,我们可以尝试重新编译Numpy库。
首先,需要先卸载掉已经安装的Numpy库:
$ pip uninstall numpy
接下来,我们需要下载最新版本的Numpy源代码,并执行以下命令进行编译安装:
$ git clone https://github.com/numpy/numpy.git
$ cd numpy
$ python setup.py build && python setup.py install
方法三:使用Anaconda发行版
如果以上两种方法均无法解决问题,我们可以尝试使用Anaconda发行版。
Anaconda是一个用于科学计算的Python发行版,内置了常用的科学计算库,并且这些库都是经过优化和测试的。因此,使用Anaconda发行版可以避免很多由依赖库版本不兼容所带来的困扰。
安装Anaconda非常简单,只需要从官网下载对应操作系统的安装包即可:https://www.anaconda.com/products/individual
总结
Numpy库是Python中一个非常常用的科学计算库,但在使用中可能会遇到一些不兼容的问题。其中,lapack_lite.so: undefined symbol错误是一个非常常见的问题。通过本文介绍的三种方法,我们可以很好地解决这个问题,保证Numpy库的正常使用。
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