Numpy库导入时出现的错误:lapack_lite.so: undefined symbol

Numpy库导入时出现的错误:lapack_lite.so: undefined symbol

在本文中,我们将介绍在使用Numpy库时,可能会遇到的一种错误:lapack_lite.so: undefined symbol。该错误通常是由于Numpy库的依赖库OpenBLAS版本不兼容所导致的。具体表现为在Python的交互式环境或者运行脚本时,导入Numpy库时出现以下错误提示:

ImportError: /path/to/numpy/linalg/lapack_lite.so: undefined symbol: zgelsd_

或者

ImportError: /path/to/numpy/linalg/lapack_lite.so: undefined symbol: dgetf2_

其中,zgelsd_和dgetf2_是OpenBLAS库中定义的函数。

阅读更多:Numpy 教程

解决方法

我们可以通过以下三种方法,解决Numpy导入时出现的undefined symbol错误。

方法一:更新OpenBLAS库

错误的根本原因是Numpy库需要的依赖库OpenBLAS版本不兼容。因此,我们可以尝试更新OpenBLAS库。

一种简单的方法是使用系统自带的软件包管理器进行更新。以Ubuntu系统为例,可以使用以下命令进行更新:

$ sudo apt-get update
$ sudo apt-get install libopenblas-dev

如果系统自带的OpenBLAS库已经是最新的,也可以尝试从OpenBLAS官网上下载最新版本的库进行编译安装。以Linux系统为例,可以使用以下命令进行编译安装:

$ wget https://github.com/xianyi/OpenBLAS/archive/v0.3.13.tar.gz
$ tar -zxvf v0.3.13.tar.gz && cd OpenBLAS-0.3.13
$ make -j$(nproc) && sudo make install

方法二:重新编译Numpy库

如果更新OpenBLAS库仍然无法解决问题,我们可以尝试重新编译Numpy库。

首先,需要先卸载掉已经安装的Numpy库:

$ pip uninstall numpy

接下来,我们需要下载最新版本的Numpy源代码,并执行以下命令进行编译安装:

$ git clone https://github.com/numpy/numpy.git
$ cd numpy
$ python setup.py build && python setup.py install

方法三:使用Anaconda发行版

如果以上两种方法均无法解决问题,我们可以尝试使用Anaconda发行版。

Anaconda是一个用于科学计算的Python发行版,内置了常用的科学计算库,并且这些库都是经过优化和测试的。因此,使用Anaconda发行版可以避免很多由依赖库版本不兼容所带来的困扰。

安装Anaconda非常简单,只需要从官网下载对应操作系统的安装包即可:https://www.anaconda.com/products/individual

总结

Numpy库是Python中一个非常常用的科学计算库,但在使用中可能会遇到一些不兼容的问题。其中,lapack_lite.so: undefined symbol错误是一个非常常见的问题。通过本文介绍的三种方法,我们可以很好地解决这个问题,保证Numpy库的正常使用。

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