Numpy:这段cython代码能够进行优化吗

Numpy:这段cython代码能够进行优化吗

在本文中,我们将介绍如何优化使用Numpy的cython代码。cython是一种用于编写Python的C扩展。与其他如Python、C、C++等编程语言相比,cython可以提供更加高效的执行速度。Numpy是Python中一个非常有用的数学库,常常被用来处理大型的数学计算。

阅读更多:Numpy 教程

Cython代码

下面我们来看一个简单的cython代码,该代码实现了一个计算余弦夹角的函数。

import numpy as np
cimport numpy as np

def cosine_similarity(np.ndarray[double, ndim=1] a, np.ndarray[double, ndim=1] b):
    cdef double dot = 0, ma = 0, mb = 0
    cdef Py_ssize_t i, n = a.shape[0]
    for i in range(n):
        dot += a[i] * b[i]
        ma += a[i] * a[i]
        mb += b[i] * b[i]
    return dot / np.sqrt(ma * mb)
Cython

问题与性能分析

上面的代码能够正常运行,但正如我们所知,Numpy使用起来非常方便,能够在其自己的C语言后端中高效运行。在这种情况下,使用Numpy库可以让我们的代码更加高效。让我们来分析一下这段代码的问题。

上面的代码中,我们可以看到一些使用Numpy的方法,但也有一些普通的Python列表操作方法。这就意味着,每次使用普通的Python列表时,都要进行Python和C语言之间的切换。此切换非常低效,能够产生大量的开销。因此,我们需要尽可能多地使用Numpy的相关函数,以减少这些切换的次数。在下文中,我们将使用Numpy中的函数来重写上面的代码。

重写使用Numpy

我们可以使用Numpy中的相关函数来修改上面的代码。以下是修改后的代码:

import numpy as np
cimport numpy as np

def cosine_similarity(np.ndarray[double, ndim=1] a, np.ndarray[double, ndim=1] b):
    cdef double dot = np.dot(a, b)
    cdef double ma = np.dot(a, a)
    cdef double mb = np.dot(b, b)
    return dot / np.sqrt(ma * mb)
Cython

修改后的代码使用了Numpy中的dot函数来计算点积,而不是遍历列表。这显然会更加高效,因为Numpy的函数是使用C语言编写的,不需要像Python列表那样在Python和C语言之间进行切换。另外,这次修改中也使用了Numpy的sqrt函数,以取代math库的sqrt函数。在实际情况中,Numpy的sqrt函数可能会更快。

性能比较

下面我们来比较两段代码的性能。首先,我们可以使用Cython自带的“%%cython”魔法来测量第一段代码的性能。

%load_ext cython

%%cython -a
import numpy as np

def cosine_similarity_cython(a, b):
    cdef double dot = 0, ma = 0, mb = 0
    n = a.shape[0]
    for i in range(n):
        dot += a[i] * b[i]
        ma += a[i] * a[i]
        mb += b[i] * b[i]
    return dot / np.sqrt(ma * mb)

a = np.random.rand(10000)
b = np.random.rand(10000)

cosine_similarity_cython(a, b)
Cython

上述代码的“-a”参数将使我们得到一个对于代码的高亮和性能信息的HTML页面,该页面会使用不同的颜色表示出性能和静态类型化信息。我们可以看到,上述代码的“-a”参数将使我们得到一个对于代码的高亮和性能信息的HTML页面,该页面会使用不同的颜色表示出性能和静态类型化信息。我们可以看到,上述代码的性能非常低,主要原因是使用了普通的Python列表操作方法。

接下来,我们来测试改进后的代码的性能:

%load_ext cython

%%cython -a
import numpy as np

def cosine_similarity_cython_v2(a, b):
    dot = np.dot(a, b)
    ma = np.dot(a, a)
    mb = np.dot(b, b)
    return dot / np.sqrt(ma * mb)

a = np.random.rand(10000)
b = np.random.rand(10000)

cosine_similarity_cython_v2(a, b)
Cython

我们可以看到,改进后的代码性能有了显著提升。这是由于我们使用了Numpy中的相关函数,以减少了Python和C语言之间的切换次数。当然,Numpy中的函数通常会比纯Python代码更快,因为它们是使用C语言编写的。

总结

在本文中,我们介绍了如何优化使用Numpy的cython代码。我们发现,使用Numpy中的相关函数可以提高代码的执行效率,减少Python和C语言之间的切换次数。尽管这个例子很简单,但这种优化方法在处理大型数据集和进行数据分析时非常有用。因此,我们鼓励大家在编写Python代码时,尽可能多地使用Numpy和其他科学计算库,以提高代码的性能和效率。

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