Numpy 浮点数精度丢失问题
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背景
在使用pandas的read_csv函数读取数据时,经常会使用numpy的dtype来指定读取数据的数据类型。但是,使用numpy的dtype时,会遇到一些精度丢失的问题,这对于科学计算的精度要求非常高的数据来说,是一个极大的隐患。
问题
pandas的read_csv函数默认会将数据转成float64类型,但是在处理大规模数据时,我们可能会根据自己的需求选择使用更小的数据类型来节省内存,比如float32类型。以下是一个示例代码:
import pandas as pd
import numpy as np
df = pd.read_csv('data.csv', dtype={'col1': np.float32, 'col2': np.float32})
就是这样一个简单的代码,我们使用了numpy的float32类型来指定数据类型。但是,我们会发现数据中的一些小数位已经被截断了,这便是精度丢失的问题。
原因
精度丢失的原因是因为numpy的float32类型只能提供23位有效数字,而float64类型提供的是53位有效数字。当我们使用read_csv函数读取数据时,默认会使用numpy的float64类型来存储数据,所以数据中的小数位不会丢失。但是,当我们指定使用float32类型来存储数据时,由于float32类型只提供23位有效数字,所以数据中的小数位就被截断了。
解决方案
1. 使用更高的数据类型
为了避免精度丢失问题,我们可以选择使用更高的数据类型,比如使用float64类型。但是,这样会对内存空间造成一定的压力。不过,在处理小规模数据时,使用float64类型并不会对内存造成太大的影响。
2. 修改read_csv函数参数
我们可以通过修改read_csv函数的参数来解决精度丢失的问题。
首先,我们可以指定使用numpy的dtype参数,而不是字典形式的dtype参数。当我们使用numpy的dtype参数时,numpy会根据数据来自动选择数据类型,这样就能避免精度丢失的问题。以下是一个示例代码:
import pandas as pd
import numpy as np
df = pd.read_csv('data.csv', dtype=np.float64)
在上面的代码中,我们将数据类型指定为np.float64,这样就能保证数据读取时不会丢失精度。
其次,我们可以设置float_precision参数。这个参数默认为”high”,表示使用最高的精度来存储数据。如果我们修改为”round_trip”,则表示遵守IETF标准,即使用read_csv时存储精度和写入文件时的确认或精度设置一致。
以下是一个示例代码:
import pandas as pd
import numpy as np
df = pd.read_csv('data.csv', float_precision='round_trip')
3. 损失一些精度的信息
当我们需要更高的效率时,我们可以选择牺牲一些精度的信息来达到效率的提升。比如,我们可以将float32类型变成int32类型,这样就可以将小数位转化为整数位,虽然精度有所丢失,但是效率会有大幅提高。
以下是一个示例代码:
import pandas as pd
import numpy as np
df = pd.read_csv('data.csv', dtype={'col1': np.int32, 'col2': np.int32})
df['col1'] /= 10000
df['col2'] /= 10000
在上面的代码中,我们将float32类型转换为int32类型,并将小数点后四位变成整数位。虽然而,这样会有一定的精度丢失,需要根据具体情况进行权衡。
总结
在使用pandas的read_csv函数读取数据时,如果不做任何额外设置,会默认使用numpy的float64类型来存储数据。但是,在处理大规模数据时,我们可能会选择更小的数据类型来节省内存。然而,使用float32类型时会遇到精度丢失的问题,因为float32类型只提供23位有效数字,而float64类型提供的是53位有效数字。为了避免这个问题,我们可以选择使用更高的数据类型,或者修改read_csv函数的参数来调整数据类型解析方式。当然,如果我们希望提升效率,我们也可以选择以损失一些精度的代价来达到效率的提升。需要根据具体情况进行权衡。
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