Biopython 测试技术

Biopython有大量的测试脚本，在不同的条件下测试软件，以确保软件没有错误。要运行测试脚本，请下载Biopython的源代码，然后运行下面的命令 —

python run_tests.py

This will run all the test scripts and gives the following output −

Python version: 2.7.12 (v2.7.12:d33e0cf91556, Jun 26 2016, 12:10:39) 
[GCC 4.2.1 (Apple Inc. build 5666) (dot 3)] 
Operating system: posix darwin 
test_Ace ... ok 
test_Affy ... ok 
test_AlignIO ... ok 
test_AlignIO_ClustalIO ... ok 
test_AlignIO_EmbossIO ... ok 
test_AlignIO_FastaIO ... ok 
test_AlignIO_MauveIO ... ok 
test_AlignIO_PhylipIO ... ok 
test_AlignIO_convert ... ok 
........................................... 
...........................................

We can also run individual test script as specified below −

python test_AlignIO.py

结语

正如我们已经了解到的，Biopython是生物信息学领域的重要软件之一。由于是用python编写的（容易学习和编写），它提供了广泛的功能来处理生物信息学领域的任何计算和操作。它还为几乎所有流行的生物信息学软件提供了简单而灵活的接口，以利用其功能。